パソコンのデフラグ機能と同じです。同一メディア内で削除や移動、コピーなどによってデーターや空き領域が断片化した場合にメディアに正常に記録できなくなる事があります。この様なときにはクリーンアップを行うか、データをＰＣ等にバックアップしてからフォーマットしてお使いになる事をお勧めします。
クリーンアップにはACアダプター接続が必要です。また断片化状態によっては時間が掛かる場合が有りますので、ご注意ください。