抵抗入りコードを使用しているケースが考えられます。
マイク端子を利用する場合に使う抵抗入りコードをライン入力、外部入力と言う端子に使うと音が小さいと言う症状が起こります。
これは原理上、起こり得ることで故障ではありません。
使用のコードが抵抗入りか、そうではでないか確認してみてください。